三級甲等醫院是依照中國現行《醫院分級管理辦法》等的規定劃分的醫療機構級別，是中國內地對醫院實行“三級六等”的劃分等級中的最高級別。云南省衛生健康委按照《醫院評審暫行辦法》《三級心血管病醫院評審標準》等規定分別從現場評價、醫療信息統計評價、社會評價、書面評價4方面進行評審。
云南省三級甲等醫院名單：
1、云南中醫學院附屬醫院（云南省中醫院）
昆明市盤龍區光華街120號 
2、云南省第一人民醫院（昆華醫院）
昆明市金碧路157號 
3、云南省第二人民醫院（云南省紅十字會醫院）
 昆明市青年路176號 
4、昆明市醫學院第一附屬醫院（云大醫院）
昆明市五華區西昌路295號 
5、云南省建工醫院云南省工人醫院
昆明市五華區昆建路22號 
6、昆明醫學院第二附屬醫院
昆明市西山區麻園1號
7、昆明市婦幼保健院
華山西路5號
8、云南省婦幼保健院
鼓樓路200號
9、昆明醫科大學第三附屬醫院（腫瘤醫院）
昆州路519號
10、昆明市兒童醫院
前興路288號
11、云南省精神病院
穿金路733號
12、云南省第三人民醫院（鐵路醫院）
北京路292號
13、昆明市第三人民醫院
吳井路319號
14、昆明市第一人民醫院 
昆明市盤龍區青年路504號 
15、昆明市第二人民醫院云南康復醫院 
昆明市官渡區茨壩黑龍潭 
16、昆明市中醫醫院
昆明市盤龍區東風東路25號 
17、昆明市延安醫院
昆明市盤龍區人民東路245號
18、云南省阜外心血管病醫院
昆明市五華泛亞科技新區沙河北路 
19、云南昆鋼醫院
昆明市安寧市金方街道鋼河南路
20、昆明市東川區人民醫院 
昆明市東川區新村團結路45號 
21、西雙版納州人民醫院
景洪市嘎蘭南路17號
22、玉溪市人民醫院
玉溪市州城區紅塔路14號 文
23、玉溪市中醫醫院
玉溪市紅塔路40號 
24、大理白族自治州人民醫院
大理市下關區人民南路122號
25、紅河州第三人民醫院、紅河州腫瘤醫院
紅河州哈尼族彝族自治州個舊市金湖東路229號 
26、解放軍昆明總醫院
云南省昆明市大觀路212號